13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0062 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0062  calcium-binding EF-hand-containing protein  100 
 
 		 126 aa  245  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0042  calcium-binding EF-hand-containing protein  99.21 
 
 		 126 aa  243  8e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.352285  normal  0.420457 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0065  signal transduction protein  49.18 
 
 		 122 aa  100  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0097  calcium-binding EF-hand-containing protein  51.82 
 
 		 132 aa  97.8  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3772  hypothetical protein  58 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0190888 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0112  acid shock protein-like  51.11 
 
 		 126 aa  52.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.51175 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0440  calcium-binding EF-hand protein  32.86 
 
 		 226 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0765893  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0757  hypothetical protein  36.23 
 
 		 203 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1629  signal transduction protein  36.36 
 
 		 170 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2469  putative signal transduction protein with EFhand domain  43.48 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2166  calcium-binding EF-hand  33.33 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1140  calcium-binding EF-hand-containing protein  46.94 
 
 		 269 aa  40  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.229297 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2134  hypothetical protein  35.29 
 
 		 99 aa  40  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.860865  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>