28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0065 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0065  signal transduction protein  100 
 
 		 122 aa  239  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0062  calcium-binding EF-hand-containing protein  48.76 
 
 		 126 aa  95.1  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0042  calcium-binding EF-hand-containing protein  48.76 
 
 		 126 aa  95.1  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.352285  normal  0.420457 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0097  calcium-binding EF-hand-containing protein  44.53 
 
 		 132 aa  73.6  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0112  acid shock protein-like  55.17 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.51175 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0985  signal transduction protein  41.46 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3772  hypothetical protein  46.67 
 
 		 106 aa  51.6  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0190888 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2469  putative signal transduction protein with EFhand domain  40.35 
 
 		 125 aa  48.9  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2774  hypothetical protein  51.06 
 
 		 128 aa  47.4  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0490607  normal  0.181658 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1626  Calcium-binding EF-hand-containing protein  34.23 
 
 		 162 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1950  signal transduction protein  45.83 
 
 		 112 aa  46.2  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.598252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0389  hypothetical protein  38.1 
 
 		 131 aa  45.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0896126  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3579  calcium-binding EF-hand  42.31 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.56179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1363  signal transduction protein  37.5 
 
 		 202 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5705  calcium-binding EF-hand-containing protein  39.66 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0268873  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5773  hypothetical protein  46.51 
 
 		 109 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0440  calcium-binding EF-hand protein  48.84 
 
 		 226 aa  44.3  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0765893  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1629  signal transduction protein  40.23 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  38.18 
 
 		 205 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  42.31 
 
 		 190 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  40.43 
 
 		 205 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2724  calcium-binding EF-hand  32.29 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46530  hypothetical protein  38.98 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00204411  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  36.36 
 
 		 194 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2166  calcium-binding EF-hand  36.51 
 
 		 72 aa  40.8  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04240  hypothetical protein  45.45 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1110  hypothetical protein  43.9 
 
 		 187 aa  40.4  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.124565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1600  hypothetical protein  36.84 
 
 		 114 aa  40.4  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>