18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0985 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0985  signal transduction protein  100 
 
 		 196 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1363  signal transduction protein  62.71 
 
 		 202 aa  87.4  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0112  acid shock protein-like  50.85 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.51175 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0065  signal transduction protein  37.84 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0543  hypothetical protein  25.45 
 
 		 366 aa  50.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0097  calcium-binding EF-hand-containing protein  46.67 
 
 		 132 aa  47.8  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  51.16 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  51.16 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2469  putative signal transduction protein with EFhand domain  40.74 
 
 		 125 aa  46.6  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1629  signal transduction protein  36.27 
 
 		 170 aa  46.6  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0661  signal transduction protein  31.09 
 
 		 125 aa  47  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.152046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3772  hypothetical protein  42.11 
 
 		 106 aa  43.5  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0190888 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14031  hypothetical protein  36.67 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.10797 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04624  hypothetical protein  44.19 
 
 		 135 aa  43.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  45.45 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5705  calcium-binding EF-hand-containing protein  42.22 
 
 		 154 aa  43.1  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0268873  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2002  hypothetical protein  48.94 
 
 		 146 aa  42  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0346  Calcium-binding EF-hand-containing protein  47.5 
 
 		 136 aa  42.4  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>