101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3389 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  100 
 
 		 205 aa  414  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  98.05 
 
 		 205 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  72.33 
 
 		 194 aa  275  3e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3380  signal transduction protein  46.15 
 
 		 209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  54.76 
 
 		 190 aa  129  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1110  hypothetical protein  37.32 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.124565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5853  hypothetical protein  49.18 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.502913  normal  0.827274 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1482  acid-shock protein  34.84 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0389  hypothetical protein  41.43 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0896126  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3579  calcium-binding EF-hand  46.97 
 
 		 122 aa  63.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.56179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0991  calcium-binding EF-hand-containing protein  36.13 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0245104  normal  0.296766 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04858  EF hand domain protein  32.48 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.269364  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5773  hypothetical protein  44.44 
 
 		 109 aa  62  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2059a  hypothetical protein  45 
 
 		 105 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2073  signal transduction protein  38.89 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0851765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5798  Calcium-binding EF-hand-containing protein  33.04 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2724  calcium-binding EF-hand  44.44 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04624  hypothetical protein  41.67 
 
 		 135 aa  57  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2469  putative signal transduction protein with EFhand domain  33 
 
 		 125 aa  57  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1174  hypothetical protein  35.29 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2405  hypothetical protein  39.34 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2341  signal transduction protein  37.07 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00164807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0081  Calcium-binding EF-hand-containing protein  28.76 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4199  signal transduction protein  30.53 
 
 		 282 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03592  EF hand domain protein  36.11 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.306427  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3135  calcium-binding EF-hand  28.48 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.850385  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0584  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.506035  hitchhiker  0.00941116 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0950  signal transduction protein  33.59 
 
 		 242 aa  53.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0133  hypothetical protein  34.38 
 
 		 133 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.165134  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0616  hypothetical protein  34.38 
 
 		 133 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.642122  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3698  hypothetical protein  31.88 
 
 		 132 aa  51.6  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.386998  normal  0.597407 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0541  hypothetical protein  35.94 
 
 		 134 aa  52  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46530  hypothetical protein  34.33 
 
 		 101 aa  52  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00204411  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0517  hypothetical protein  34.38 
 
 		 132 aa  51.6  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.528865  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2148  calcium-binding EF-hand-containing protein  32.5 
 
 		 143 aa  51.2  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2491  hypothetical protein  30.88 
 
 		 133 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3490  hypothetical protein  30.88 
 
 		 133 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0411  hypothetical protein  30.88 
 
 		 133 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22812  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1629  signal transduction protein  39.73 
 
 		 170 aa  50.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1271  hypothetical protein  30.88 
 
 		 133 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3453  hypothetical protein  30.88 
 
 		 133 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574961  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3491  hypothetical protein  30.88 
 
 		 165 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2769  hypothetical protein  34.38 
 
 		 133 aa  51.2  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1114  hypothetical protein  34.13 
 
 		 153 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0883796 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1266  calcium-binding EF-hand-containing protein  30.58 
 
 		 167 aa  50.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.567  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3184  calcium-binding EF-hand-containing protein  34.45 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53519  normal  0.491229 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0985  signal transduction protein  37.84 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14031  hypothetical protein  31.19 
 
 		 171 aa  50.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.10797 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3294  hypothetical protein  30.88 
 
 		 160 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0065  signal transduction protein  37.29 
 
 		 122 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4161  Calcium-binding EF-hand-containing protein  33.58 
 
 		 139 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0440  calcium-binding EF-hand protein  29.8 
 
 		 226 aa  49.7  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0765893  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3880  hypothetical protein  42.31 
 
 		 109 aa  48.9  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2178  hypothetical protein  34.38 
 
 		 167 aa  48.9  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0312897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0346  Calcium-binding EF-hand-containing protein  50 
 
 		 136 aa  48.9  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4424  calcium-binding EF-hand-containing protein  38.1 
 
 		 160 aa  48.5  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163959  normal  0.98941 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21006  predicted protein  26.56 
 
 		 466 aa  48.5  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.540977  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04240  hypothetical protein  39.58 
 
 		 99 aa  48.1  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2235  calcium-binding domain-containing protein  31.71 
 
 		 118 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.538566  normal  0.506207 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3298  hypothetical protein  42.11 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3284  signal transduction protein  33.33 
 
 		 139 aa  47.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0725465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4425  hypothetical protein  33.94 
 
 		 139 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5866  hypothetical protein  46.94 
 
 		 137 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.91114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3976  signal transduction protein  45.83 
 
 		 149 aa  47  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.895273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0677  hypothetical protein  36.67 
 
 		 131 aa  46.6  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.730333 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1626  Calcium-binding EF-hand-containing protein  36.36 
 
 		 162 aa  47  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0833  Calcium-binding EF-hand-containing protein  42.59 
 
 		 135 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0359291  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1009  calcium-binding EF-hand  44.64 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2397  EF hand domain-containing protein  42.11 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0655  signal transduction protein  38.46 
 
 		 184 aa  45.8  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1363  signal transduction protein  46.51 
 
 		 202 aa  45.4  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3600  calcium-binding EF-hand-containing protein  31.63 
 
 		 202 aa  45.4  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.799604  normal  0.113193 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3938  calcium-binding EF-hand-containing protein  31.63 
 
 		 202 aa  45.4  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0064  Calcium-binding EF-hand-containing protein  41.67 
 
 		 213 aa  45.1  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.916763  normal  0.014453 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0757  hypothetical protein  35.45 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0139  hypothetical protein  28.06 
 
 		 162 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0820746  normal  0.13795 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2002  hypothetical protein  40.35 
 
 		 146 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01720  calcium-binding EF-hand protein  41.79 
 
 		 92 aa  44.3  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02173  calcium-dependent mitochondrial carrier protein, putative (Eurofung)  28 
 
 		 580 aa  43.5  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00497794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0416  calcium-binding EF-hand domain-containing protein  31.78 
 
 		 218 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2277  calcium-binding EF-hand  44.9 
 
 		 155 aa  43.9  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677939  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2853  hypothetical protein  38.6 
 
 		 173 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.652841  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0152  signal transduction protein  40.74 
 
 		 140 aa  43.5  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04241  EF hand domain protein  43.75 
 
 		 113 aa  43.5  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2758  hypothetical protein  32.26 
 
 		 120 aa  43.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.8754 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5705  calcium-binding EF-hand-containing protein  34.29 
 
 		 154 aa  42.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0268873  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3604  signal transduction protein  29.5 
 
 		 137 aa  43.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0412957  hitchhiker  0.00158231 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4339  putative signal transduction protein with EFhand domain  42.11 
 
 		 256 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.1378  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0450  hypothetical protein  40 
 
 		 266 aa  42.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2968  calcium-binding EF-hand-containing protein  31.69 
 
 		 209 aa  42.7  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0334384 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1986  putative signal peptide protein  30.7 
 
 		 122 aa  42.7  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0043  hypothetical protein  33.72 
 
 		 110 aa  42.4  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0382289 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0661  signal transduction protein  41.67 
 
 		 125 aa  42.4  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.152046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0988  hypothetical protein  36.84 
 
 		 154 aa  42.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0640  putative signal transduction protein with EFhand domain  41.67 
 
 		 125 aa  42.4  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.416119  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4301  calcium-binding EF-hand-containing protein  34.34 
 
 		 151 aa  42  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.699333  normal  0.0950575 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1140  calcium-binding EF-hand-containing protein  23.23 
 
 		 269 aa  41.6  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.229297 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2116  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  42.22 
 
 		 387 aa  41.6  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1424  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  41.67 
 
 		 392 aa  41.6  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2163  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  42.22 
 
 		 387 aa  41.6  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273645  normal  0.931935 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>