38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2469 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2469  putative signal transduction protein with EFhand domain  100 
 
 		 125 aa  253  5e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  37.23 
 
 		 190 aa  62  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3380  signal transduction protein  35.79 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  33 
 
 		 205 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  33 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  31.63 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1110  hypothetical protein  34.31 
 
 		 187 aa  54.3  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.124565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1986  putative signal peptide protein  30.95 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1363  signal transduction protein  47.92 
 
 		 202 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0065  signal transduction protein  40.35 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0985  signal transduction protein  40.74 
 
 		 196 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0097  calcium-binding EF-hand-containing protein  43.14 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2178  hypothetical protein  32.74 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0312897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0175  calcium-binding EF-hand-containing protein  27.43 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.288154  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0112  acid shock protein-like  36.54 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.51175 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04624  hypothetical protein  41.67 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0984  hypothetical protein  41.18 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5705  calcium-binding EF-hand-containing protein  43.18 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0268873  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3976  signal transduction protein  36.36 
 
 		 149 aa  42  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.895273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5990  putative signal peptide protein  29.03 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0450  hypothetical protein  43.33 
 
 		 266 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1838  hypothetical protein  26.32 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04858  EF hand domain protein  29.27 
 
 		 193 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.269364  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1629  signal transduction protein  40.91 
 
 		 170 aa  41.6  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0655  signal transduction protein  34.43 
 
 		 184 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4199  signal transduction protein  30.84 
 
 		 282 aa  41.6  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3772  hypothetical protein  45.45 
 
 		 106 aa  41.2  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0190888 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0062  calcium-binding EF-hand-containing protein  43.18 
 
 		 126 aa  41.2  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2405  hypothetical protein  28.33 
 
 		 97 aa  41.2  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0042  calcium-binding EF-hand-containing protein  43.18 
 
 		 126 aa  41.2  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.352285  normal  0.420457 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17199  2-phosphoglycolate phosphatase  38.6 
 
 		 517 aa  41.2  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.493472  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0640  putative signal transduction protein with EFhand domain  38.64 
 
 		 125 aa  40.8  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.416119  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2165  hypothetical protein  41.67 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01129  putative calcium binding protein  41.18 
 
 		 221 aa  40.8  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0661  signal transduction protein  38.64 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.152046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5798  Calcium-binding EF-hand-containing protein  34.62 
 
 		 97 aa  40.4  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12351  hypothetical protein  31.82 
 
 		 129 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.337711  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02173  calcium-dependent mitochondrial carrier protein, putative (Eurofung)  23.23 
 
 		 580 aa  40  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00497794  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>