31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1986 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1986  putative signal peptide protein  100 
 
 		 122 aa  244  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5990  putative signal peptide protein  50.82 
 
 		 119 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4425  hypothetical protein  34.17 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4161  Calcium-binding EF-hand-containing protein  31.58 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8024  Calcium-binding EF-hand-containing protein  40.24 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0823  hypothetical protein  27.87 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.112496 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0271  Calcium-binding EF-hand-containing protein  34.41 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0508826 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2235  calcium-binding domain-containing protein  34.12 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.538566  normal  0.506207 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0757  hypothetical protein  39.13 
 
 		 203 aa  53.5  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1805  putative signal transduction protein with EFhand domain  34.12 
 
 		 133 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.537311 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4301  calcium-binding EF-hand-containing protein  34.12 
 
 		 151 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.699333  normal  0.0950575 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1482  acid-shock protein  30 
 
 		 188 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2469  putative signal transduction protein with EFhand domain  30.95 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3604  signal transduction protein  27.59 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0412957  hitchhiker  0.00158231 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1854  hypothetical protein  31.76 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2189  putative signal transduction protein with EFhand domain  31.76 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.350959  normal  0.155575 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0223  hypothetical protein  36.47 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.893261  normal  0.0721241 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03592  EF hand domain protein  35.29 
 
 		 112 aa  44.3  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.306427  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04858  EF hand domain protein  29.41 
 
 		 193 aa  44.3  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.269364  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6104  calcium-binding protein  30.94 
 
 		 188 aa  42.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1110  hypothetical protein  32.41 
 
 		 187 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.124565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1867  calcium-binding protein  30.94 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0043  hypothetical protein  35.14 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0382289 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  30.7 
 
 		 205 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3284  signal transduction protein  31.37 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0725465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1228  signal transduction protein  35.06 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522863  normal  0.321089 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3738  signal transduction protein  28.89 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.970304 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3545  signal transduction protein  33.78 
 
 		 209 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000138612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  29.82 
 
 		 205 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0267  calcium-binding EF-hand  45.83 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0835  EF hand domain protein  31.31 
 
 		 144 aa  40  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>