27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0043 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0043  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  223  8e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0382289 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03592  EF hand domain protein  61.68 
 
 		 112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.306427  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3604  signal transduction protein  30.17 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0412957  hitchhiker  0.00158231 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2341  signal transduction protein  36.9 
 
 		 124 aa  47.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00164807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2148  calcium-binding EF-hand-containing protein  31.25 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4161  Calcium-binding EF-hand-containing protein  27.05 
 
 		 139 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4425  hypothetical protein  25.83 
 
 		 139 aa  47  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2235  calcium-binding domain-containing protein  31.31 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.538566  normal  0.506207 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4301  calcium-binding EF-hand-containing protein  29.9 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.699333  normal  0.0950575 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2178  hypothetical protein  36.71 
 
 		 167 aa  45.1  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0312897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3600  calcium-binding EF-hand-containing protein  32.1 
 
 		 202 aa  45.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.799604  normal  0.113193 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3938  calcium-binding EF-hand-containing protein  32.1 
 
 		 202 aa  45.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1805  putative signal transduction protein with EFhand domain  31.25 
 
 		 133 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.537311 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  34.09 
 
 		 194 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0081  Calcium-binding EF-hand-containing protein  45.24 
 
 		 212 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1854  hypothetical protein  29.17 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1986  putative signal peptide protein  35.14 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2189  putative signal transduction protein with EFhand domain  29.17 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.350959  normal  0.155575 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1110  hypothetical protein  32 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.124565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  33.72 
 
 		 205 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  33.72 
 
 		 205 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38821  predicted protein  30.49 
 
 		 469 aa  41.2  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04858  EF hand domain protein  31.62 
 
 		 193 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.269364  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0416  calcium-binding EF-hand domain-containing protein  34.57 
 
 		 218 aa  41.2  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4199  signal transduction protein  30 
 
 		 282 aa  40.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0271  Calcium-binding EF-hand-containing protein  30.7 
 
 		 130 aa  40.4  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0508826 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2384  hypothetical protein  42.22 
 
 		 163 aa  40.4  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190826 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>