28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8024 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_8024  Calcium-binding EF-hand-containing protein  100 
 
 		 134 aa  251  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4425  hypothetical protein  55.4 
 
 		 139 aa  135  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2189  putative signal transduction protein with EFhand domain  67.96 
 
 		 133 aa  135  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.350959  normal  0.155575 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1854  hypothetical protein  67.96 
 
 		 133 aa  135  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1805  putative signal transduction protein with EFhand domain  66.99 
 
 		 133 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.537311 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3604  signal transduction protein  57.03 
 
 		 137 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0412957  hitchhiker  0.00158231 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4161  Calcium-binding EF-hand-containing protein  54.23 
 
 		 139 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2235  calcium-binding domain-containing protein  57.94 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.538566  normal  0.506207 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4301  calcium-binding EF-hand-containing protein  61.54 
 
 		 151 aa  126  8.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.699333  normal  0.0950575 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0271  Calcium-binding EF-hand-containing protein  52.38 
 
 		 130 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0508826 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0823  hypothetical protein  52.38 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.112496 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2815  hypothetical protein  41.75 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11305  normal  0.1713 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1986  putative signal peptide protein  38.82 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0223  hypothetical protein  38.05 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.893261  normal  0.0721241 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2148  calcium-binding EF-hand-containing protein  29.41 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0757  hypothetical protein  41.54 
 
 		 203 aa  52.4  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0440  calcium-binding EF-hand protein  39.51 
 
 		 226 aa  50.4  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0765893  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5990  putative signal peptide protein  26.05 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2384  hypothetical protein  29.93 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190826 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3148  hypothetical protein  31.62 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0835  EF hand domain protein  28 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3284  signal transduction protein  31.43 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0725465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1867  calcium-binding protein  27.89 
 
 		 148 aa  42.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3545  signal transduction protein  36.11 
 
 		 209 aa  42.7  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000138612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2178  hypothetical protein  31.73 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0312897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6104  calcium-binding protein  27.21 
 
 		 188 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3938  calcium-binding EF-hand-containing protein  34.62 
 
 		 202 aa  40  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3600  calcium-binding EF-hand-containing protein  34.62 
 
 		 202 aa  40  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.799604  normal  0.113193 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>