27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3600 on replicon NC_009955
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009957  Dshi_3938  calcium-binding EF-hand-containing protein  100 
 
 		 202 aa  386  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3600  calcium-binding EF-hand-containing protein  100 
 
 		 202 aa  386  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.799604  normal  0.113193 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2496  hypothetical protein  41.58 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2375  calcium-binding EF-hand protein  38.61 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.572136 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4161  Calcium-binding EF-hand-containing protein  41.46 
 
 		 139 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0416  calcium-binding EF-hand domain-containing protein  39.47 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3224  hypothetical protein  29.79 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.916377  normal  0.185991 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2073  signal transduction protein  38.16 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0851765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0043  hypothetical protein  28.57 
 
 		 110 aa  47  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0382289 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2178  hypothetical protein  37.35 
 
 		 167 aa  47  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0312897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  33.7 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  33.7 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3380  signal transduction protein  32.58 
 
 		 209 aa  45.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_24253  predicted protein  30.4 
 
 		 479 aa  45.4  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.334979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1228  signal transduction protein  30.85 
 
 		 145 aa  45.1  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522863  normal  0.321089 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0950  signal transduction protein  33.01 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3135  calcium-binding EF-hand  41.33 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.850385  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4301  calcium-binding EF-hand-containing protein  32.61 
 
 		 151 aa  44.3  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.699333  normal  0.0950575 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03592  EF hand domain protein  30.49 
 
 		 112 aa  43.5  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.306427  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42106  predicted protein  32.26 
 
 		 163 aa  43.5  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.87419  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  31.91 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2341  signal transduction protein  37.8 
 
 		 124 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00164807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  30.51 
 
 		 190 aa  42.7  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3545  signal transduction protein  29.33 
 
 		 209 aa  42.4  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000138612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1110  hypothetical protein  27.84 
 
 		 187 aa  41.6  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.124565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39965  predicted protein  30.68 
 
 		 149 aa  41.6  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000214549  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2235  calcium-binding domain-containing protein  34.15 
 
 		 118 aa  41.6  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.538566  normal  0.506207 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>