28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4425 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4425  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  267  4e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4161  Calcium-binding EF-hand-containing protein  76.81 
 
 		 139 aa  197  5e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4301  calcium-binding EF-hand-containing protein  72.64 
 
 		 151 aa  149  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.699333  normal  0.0950575 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3604  signal transduction protein  56.72 
 
 		 137 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0412957  hitchhiker  0.00158231 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2235  calcium-binding domain-containing protein  56.1 
 
 		 118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.538566  normal  0.506207 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1805  putative signal transduction protein with EFhand domain  63.11 
 
 		 133 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.537311 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2189  putative signal transduction protein with EFhand domain  63.11 
 
 		 133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.350959  normal  0.155575 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1854  hypothetical protein  63.11 
 
 		 133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8024  Calcium-binding EF-hand-containing protein  54.68 
 
 		 134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0823  hypothetical protein  47.1 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.112496 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0271  Calcium-binding EF-hand-containing protein  47.2 
 
 		 130 aa  96.3  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0508826 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2815  hypothetical protein  44.34 
 
 		 139 aa  80.1  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11305  normal  0.1713 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0223  hypothetical protein  41.96 
 
 		 140 aa  72  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.893261  normal  0.0721241 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1986  putative signal peptide protein  34.17 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2148  calcium-binding EF-hand-containing protein  30.88 
 
 		 143 aa  53.5  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03592  EF hand domain protein  28 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.306427  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  33.94 
 
 		 205 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  33.94 
 
 		 205 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0043  hypothetical protein  25.83 
 
 		 110 aa  47  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0382289 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1867  calcium-binding protein  27.74 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6104  calcium-binding protein  26.67 
 
 		 188 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  28.33 
 
 		 190 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5990  putative signal peptide protein  26.83 
 
 		 119 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3380  signal transduction protein  28.8 
 
 		 209 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2178  hypothetical protein  29.5 
 
 		 167 aa  41.6  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0312897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3284  signal transduction protein  31.25 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0725465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3938  calcium-binding EF-hand-containing protein  34.15 
 
 		 202 aa  40.4  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3600  calcium-binding EF-hand-containing protein  34.15 
 
 		 202 aa  40.4  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.799604  normal  0.113193 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>