34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4301 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4301  calcium-binding EF-hand-containing protein  100 
 
 		 151 aa  290  6e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.699333  normal  0.0950575 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4161  Calcium-binding EF-hand-containing protein  62.32 
 
 		 139 aa  161  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4425  hypothetical protein  65.15 
 
 		 139 aa  153  7e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3604  signal transduction protein  57.89 
 
 		 137 aa  143  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0412957  hitchhiker  0.00158231 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1805  putative signal transduction protein with EFhand domain  66 
 
 		 133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.537311 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1854  hypothetical protein  66 
 
 		 133 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2189  putative signal transduction protein with EFhand domain  66 
 
 		 133 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.350959  normal  0.155575 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2235  calcium-binding domain-containing protein  60.17 
 
 		 118 aa  126  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.538566  normal  0.506207 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8024  Calcium-binding EF-hand-containing protein  62 
 
 		 134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0271  Calcium-binding EF-hand-containing protein  56.31 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0508826 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0823  hypothetical protein  45.86 
 
 		 138 aa  98.2  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.112496 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2815  hypothetical protein  46.6 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11305  normal  0.1713 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0223  hypothetical protein  40.78 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.893261  normal  0.0721241 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03592  EF hand domain protein  35.14 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.306427  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0043  hypothetical protein  30.43 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0382289 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1986  putative signal peptide protein  30.47 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3148  hypothetical protein  31.62 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5990  putative signal peptide protein  25.66 
 
 		 119 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3380  signal transduction protein  32.74 
 
 		 209 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2148  calcium-binding EF-hand-containing protein  30.58 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3600  calcium-binding EF-hand-containing protein  32.61 
 
 		 202 aa  43.9  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.799604  normal  0.113193 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3938  calcium-binding EF-hand-containing protein  32.61 
 
 		 202 aa  43.9  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3545  signal transduction protein  31.86 
 
 		 209 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000138612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  33.33 
 
 		 205 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  35.35 
 
 		 1831 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  33.33 
 
 		 205 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0346  Calcium-binding EF-hand-containing protein  46 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1867  calcium-binding protein  28.83 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6104  calcium-binding protein  28.83 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  33.03 
 
 		 1394 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  31.19 
 
 		 190 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0112  acid shock protein-like  40.68 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.51175 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3284  signal transduction protein  31.68 
 
 		 139 aa  40  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0725465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  35.19 
 
 		 14609 aa  40  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>