31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0346 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0346  Calcium-binding EF-hand-containing protein  100 
 
 		 136 aa  253  7e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04241  EF hand domain protein  62.86 
 
 		 113 aa  92.8  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0267  calcium-binding EF-hand  40.32 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0543  hypothetical protein  40 
 
 		 366 aa  52.4  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  47.06 
 
 		 205 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  47.06 
 
 		 205 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1110  hypothetical protein  48.89 
 
 		 187 aa  50.4  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.124565  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  38.46 
 
 		 194 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  48.08 
 
 		 190 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1629  signal transduction protein  28.95 
 
 		 170 aa  47.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0450  hypothetical protein  55 
 
 		 266 aa  46.2  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04858  EF hand domain protein  42.19 
 
 		 193 aa  46.6  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.269364  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0985  signal transduction protein  40.35 
 
 		 196 aa  43.9  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3976  signal transduction protein  31.48 
 
 		 149 aa  43.5  0.0009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.895273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03592  EF hand domain protein  43.33 
 
 		 112 aa  43.5  0.0009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.306427  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4425  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04240  hypothetical protein  36.84 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2165  hypothetical protein  51.22 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4161  Calcium-binding EF-hand-containing protein  38.1 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0661  signal transduction protein  37.21 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.152046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4301  calcium-binding EF-hand-containing protein  38.71 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.699333  normal  0.0950575 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3184  calcium-binding EF-hand-containing protein  42.19 
 
 		 225 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53519  normal  0.491229 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0640  putative signal transduction protein with EFhand domain  36.21 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.416119  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1363  signal transduction protein  37.78 
 
 		 202 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0081  Calcium-binding EF-hand-containing protein  51.28 
 
 		 212 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5798  Calcium-binding EF-hand-containing protein  40 
 
 		 97 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0152  signal transduction protein  40 
 
 		 140 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04624  hypothetical protein  43.18 
 
 		 135 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0757  hypothetical protein  45.83 
 
 		 203 aa  40.8  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2030  calcium-binding EF-hand  39.39 
 
 		 251 aa  40.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139142  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2166  calcium-binding EF-hand  32.14 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>