19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0152 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0152  signal transduction protein  100 
 
 		 140 aa  274  3e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0833  Calcium-binding EF-hand-containing protein  75 
 
 		 135 aa  135  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0359291  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5866  hypothetical protein  49.28 
 
 		 137 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.91114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2277  calcium-binding EF-hand  52.31 
 
 		 155 aa  73.6  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677939  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4424  calcium-binding EF-hand-containing protein  53.73 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163959  normal  0.98941 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0847  calcium-binding EF-hand  62 
 
 		 185 aa  71.2  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.547407  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  28.23 
 
 		 205 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  28.23 
 
 		 205 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0450  hypothetical protein  42.37 
 
 		 266 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2030  calcium-binding EF-hand  45.65 
 
 		 251 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139142  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0267  calcium-binding EF-hand  36.36 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3545  signal transduction protein  48.72 
 
 		 209 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000138612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0757  hypothetical protein  50 
 
 		 203 aa  40.8  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2815  hypothetical protein  52.78 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11305  normal  0.1713 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3976  signal transduction protein  50 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.895273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14031  hypothetical protein  40 
 
 		 171 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.10797 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0543  hypothetical protein  37.74 
 
 		 366 aa  40.4  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  37.5 
 
 		 194 aa  40.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0081  Calcium-binding EF-hand-containing protein  44.44 
 
 		 212 aa  40  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>