27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0833 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0833  Calcium-binding EF-hand-containing protein  100 
 
 		 135 aa  266  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0359291  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0152  signal transduction protein  72.86 
 
 		 140 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5866  hypothetical protein  48.55 
 
 		 137 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.91114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2277  calcium-binding EF-hand  60.56 
 
 		 155 aa  86.7  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677939  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4424  calcium-binding EF-hand-containing protein  62.75 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163959  normal  0.98941 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0847  calcium-binding EF-hand  60 
 
 		 185 aa  68.2  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.547407  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  46.15 
 
 		 194 aa  50.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  32.14 
 
 		 205 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  32.14 
 
 		 205 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0450  hypothetical protein  45.83 
 
 		 266 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2551  hypothetical protein  42.55 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0760261  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0081  Calcium-binding EF-hand-containing protein  46.3 
 
 		 212 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3380  signal transduction protein  53.33 
 
 		 209 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0440  calcium-binding EF-hand protein  53.85 
 
 		 226 aa  43.9  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0765893  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  50 
 
 		 190 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0175  calcium-binding EF-hand-containing protein  44.44 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.288154  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1839  copper resistance B precursor  47.06 
 
 		 429 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.425584  hitchhiker  0.0000315743 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0283  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  45.24 
 
 		 389 aa  41.2  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0438498 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04241  EF hand domain protein  42.86 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0064  Calcium-binding EF-hand-containing protein  40.74 
 
 		 213 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.916763  normal  0.014453 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0267  calcium-binding EF-hand  33.33 
 
 		 135 aa  40.4  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2163  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  45.24 
 
 		 387 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273645  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2116  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  45.24 
 
 		 387 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1114  hypothetical protein  51.35 
 
 		 153 aa  40.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0883796 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3298  hypothetical protein  42.86 
 
 		 218 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0757  hypothetical protein  50 
 
 		 203 aa  40.4  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1336  acid-shock protein, putative  44.74 
 
 		 184 aa  40  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>