18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5866 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5866  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  270  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.91114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2277  calcium-binding EF-hand  65.67 
 
 		 155 aa  95.1  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677939  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0833  Calcium-binding EF-hand-containing protein  76 
 
 		 135 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0359291  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0152  signal transduction protein  67.92 
 
 		 140 aa  84  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4424  calcium-binding EF-hand-containing protein  53.95 
 
 		 160 aa  80.5  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163959  normal  0.98941 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0847  calcium-binding EF-hand  50.91 
 
 		 185 aa  60.5  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.547407  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  44.26 
 
 		 194 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  46.94 
 
 		 205 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  46.94 
 
 		 205 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3380  signal transduction protein  48.98 
 
 		 209 aa  44.3  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0081  Calcium-binding EF-hand-containing protein  46.81 
 
 		 212 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0757  hypothetical protein  51.11 
 
 		 203 aa  43.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2030  calcium-binding EF-hand  38.6 
 
 		 251 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139142  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0450  hypothetical protein  37.1 
 
 		 266 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0440  calcium-binding EF-hand protein  48.84 
 
 		 226 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0765893  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  47.06 
 
 		 190 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2551  hypothetical protein  33.87 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0760261  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3545  signal transduction protein  43.9 
 
 		 209 aa  40.8  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000138612  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>