26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0440 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0440  calcium-binding EF-hand protein  100 
 
 		 226 aa  445  1.0000000000000001e-124  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0765893  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0757  hypothetical protein  40.57 
 
 		 203 aa  91.3  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2968  calcium-binding EF-hand-containing protein  36.05 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0334384 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0450  hypothetical protein  30.69 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0081  Calcium-binding EF-hand-containing protein  29.61 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  33.12 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  30.41 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  30.41 
 
 		 205 aa  52.4  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0064  Calcium-binding EF-hand-containing protein  30.72 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.916763  normal  0.014453 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0991  calcium-binding EF-hand-containing protein  26.44 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0245104  normal  0.296766 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1140  calcium-binding EF-hand-containing protein  28.1 
 
 		 269 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.229297 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2148  calcium-binding EF-hand-containing protein  29.41 
 
 		 143 aa  47  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5866  hypothetical protein  48.94 
 
 		 137 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.91114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0950  signal transduction protein  31.87 
 
 		 242 aa  46.2  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0833  Calcium-binding EF-hand-containing protein  46.81 
 
 		 135 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0359291  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0271  Calcium-binding EF-hand-containing protein  36.36 
 
 		 130 aa  46.2  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0508826 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04858  EF hand domain protein  42.03 
 
 		 193 aa  45.8  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.269364  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2277  calcium-binding EF-hand  45.83 
 
 		 155 aa  45.4  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677939  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0065  signal transduction protein  48.84 
 
 		 122 aa  45.1  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3380  signal transduction protein  29.05 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2178  hypothetical protein  32.5 
 
 		 167 aa  44.7  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0312897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1110  hypothetical protein  40.85 
 
 		 187 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.124565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4424  calcium-binding EF-hand-containing protein  34.04 
 
 		 160 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163959  normal  0.98941 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3284  signal transduction protein  35.8 
 
 		 139 aa  43.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0725465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0139  hypothetical protein  40.74 
 
 		 162 aa  42  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0820746  normal  0.13795 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3839  hypothetical protein  29.2 
 
 		 131 aa  42  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315834  normal  0.233166 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>