24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0081 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0081  Calcium-binding EF-hand-containing protein  100 
 
 		 212 aa  434  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0064  Calcium-binding EF-hand-containing protein  83.26 
 
 		 213 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.916763  normal  0.014453 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0450  hypothetical protein  38.04 
 
 		 266 aa  137  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3380  signal transduction protein  34.02 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  28.76 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  28.76 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2148  calcium-binding EF-hand-containing protein  26.53 
 
 		 143 aa  51.6  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1114  hypothetical protein  28.86 
 
 		 153 aa  49.3  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0883796 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  29.8 
 
 		 190 aa  49.3  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0440  calcium-binding EF-hand protein  31.54 
 
 		 226 aa  48.5  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0765893  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2968  calcium-binding EF-hand-containing protein  32.9 
 
 		 209 aa  46.2  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0334384 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0833  Calcium-binding EF-hand-containing protein  46.3 
 
 		 135 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0359291  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  36.49 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5866  hypothetical protein  46.81 
 
 		 137 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.91114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1948  Calcium-binding EF-hand-containing protein  26.14 
 
 		 286 aa  43.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0043  hypothetical protein  45.24 
 
 		 110 aa  43.1  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0382289 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0946  hypothetical protein  43.9 
 
 		 198 aa  43.1  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.587997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3579  calcium-binding EF-hand  44.68 
 
 		 122 aa  42.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.56179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6104  calcium-binding protein  26.85 
 
 		 188 aa  42.4  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2724  calcium-binding EF-hand  43.86 
 
 		 117 aa  42.4  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2148  hypothetical protein  24.84 
 
 		 236 aa  42  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.371725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1867  calcium-binding protein  26.85 
 
 		 148 aa  42  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1140  calcium-binding EF-hand-containing protein  29.8 
 
 		 269 aa  41.6  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.229297 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0795  Calcium-binding EF-hand-containing protein  24.14 
 
 		 396 aa  41.6  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.447265 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>