40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04858 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04858  EF hand domain protein  100 
 
 		 193 aa  384  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.269364  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1110  hypothetical protein  63.54 
 
 		 187 aa  189  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.124565  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  37.1 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  33.33 
 
 		 205 aa  61.2  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  33.33 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2148  calcium-binding EF-hand-containing protein  32.21 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0757  hypothetical protein  35.54 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0991  calcium-binding EF-hand-containing protein  32.07 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0245104  normal  0.296766 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  33.93 
 
 		 190 aa  52.8  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3380  signal transduction protein  31.52 
 
 		 209 aa  52.4  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2178  hypothetical protein  32.14 
 
 		 167 aa  50.4  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0312897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2968  calcium-binding EF-hand-containing protein  35.07 
 
 		 209 aa  48.1  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0334384 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1986  putative signal peptide protein  29.41 
 
 		 122 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3839  hypothetical protein  34.95 
 
 		 131 aa  47.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315834  normal  0.233166 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0677  hypothetical protein  33.83 
 
 		 131 aa  46.6  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.730333 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04624  hypothetical protein  29.41 
 
 		 135 aa  46.2  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2165  hypothetical protein  38.78 
 
 		 68 aa  46.2  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3224  hypothetical protein  33.01 
 
 		 209 aa  45.4  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.916377  normal  0.185991 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0440  calcium-binding EF-hand protein  42.03 
 
 		 226 aa  45.4  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0765893  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87042  predicted protein  28.97 
 
 		 174 aa  44.7  0.0009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1114  hypothetical protein  34.38 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0883796 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0175  calcium-binding EF-hand-containing protein  33.02 
 
 		 147 aa  43.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.288154  normal  0.986059 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02173  calcium-dependent mitochondrial carrier protein, putative (Eurofung)  30.93 
 
 		 580 aa  43.5  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00497794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0640  putative signal transduction protein with EFhand domain  53.85 
 
 		 125 aa  43.5  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.416119  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2469  putative signal transduction protein with EFhand domain  29.76 
 
 		 125 aa  43.9  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0043  hypothetical protein  31.62 
 
 		 110 aa  43.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0382289 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2166  calcium-binding EF-hand  37.25 
 
 		 72 aa  43.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0661  signal transduction protein  53.85 
 
 		 125 aa  43.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.152046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1950  signal transduction protein  37.38 
 
 		 112 aa  43.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.598252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1266  calcium-binding EF-hand-containing protein  29.6 
 
 		 167 aa  43.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.567  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5705  calcium-binding EF-hand-containing protein  39.58 
 
 		 154 aa  42.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0268873  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1600  hypothetical protein  45.24 
 
 		 114 aa  43.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5990  putative signal peptide protein  32.5 
 
 		 119 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3976  signal transduction protein  51.28 
 
 		 149 aa  42.4  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.895273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3284  signal transduction protein  34.69 
 
 		 139 aa  41.6  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0725465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0097  calcium-binding EF-hand-containing protein  42.11 
 
 		 132 aa  41.6  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND00260  calcium-dependent protein serine/threonine phosphatase, putative  30.97 
 
 		 175 aa  41.6  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.877349  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1629  signal transduction protein  37.5 
 
 		 170 aa  41.6  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0346  Calcium-binding EF-hand-containing protein  44.44 
 
 		 136 aa  41.2  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3545  signal transduction protein  38.89 
 
 		 209 aa  41.2  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000138612  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>