20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1950 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1950  signal transduction protein  100 
 
 		 112 aa  232  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.598252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0065  signal transduction protein  43.4 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3545  signal transduction protein  36.23 
 
 		 209 aa  44.7  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000138612  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  40.62 
 
 		 194 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3206  sulfatase  38.24 
 
 		 586 aa  44.7  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.338438  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1110  hypothetical protein  41.03 
 
 		 187 aa  44.3  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.124565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3298  hypothetical protein  45.65 
 
 		 218 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2148  calcium-binding EF-hand-containing protein  43.14 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  37.5 
 
 		 205 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04858  EF hand domain protein  37.38 
 
 		 193 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.269364  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  37.5 
 
 		 205 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND00260  calcium-dependent protein serine/threonine phosphatase, putative  32.26 
 
 		 175 aa  42  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.877349  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0097  calcium-binding EF-hand-containing protein  37.33 
 
 		 132 aa  41.2  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2397  EF hand domain-containing protein  43.48 
 
 		 218 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3672  hypothetical protein  28.87 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1266  calcium-binding EF-hand-containing protein  31.73 
 
 		 167 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.567  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12351  hypothetical protein  30.38 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.337711  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5798  Calcium-binding EF-hand-containing protein  32.93 
 
 		 97 aa  41.2  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2853  hypothetical protein  36.99 
 
 		 173 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.652841  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3380  signal transduction protein  40.35 
 
 		 209 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>