30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2853 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2853  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  348  2e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.652841  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0988  hypothetical protein  50.57 
 
 		 154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2002  hypothetical protein  52.8 
 
 		 146 aa  154  7e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3298  hypothetical protein  59.63 
 
 		 218 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2397  EF hand domain-containing protein  59.63 
 
 		 218 aa  134  8e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4832  hypothetical protein  40.48 
 
 		 135 aa  111  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.128133  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1502  hypothetical protein  51.52 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.387853  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2580  hypothetical protein  41.94 
 
 		 143 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0433297  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2007  hypothetical protein  44.95 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1763  hypothetical protein  41.13 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00142931  hitchhiker  0.00932404 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2621  hypothetical protein  41.13 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00231504  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2696  hypothetical protein  37.04 
 
 		 142 aa  62  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1836  hypothetical protein  43.64 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21570  hypothetical protein  43.93 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2260  hypothetical protein  41.28 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00464022  normal  0.48524 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2387  hypothetical protein  41.53 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000879292  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2332  hypothetical protein  38.53 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00550245  hitchhiker  0.00911187 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1304  hypothetical protein  37.04 
 
 		 147 aa  53.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.281387  normal  0.0615794 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2241  hypothetical protein  39.67 
 
 		 146 aa  49.3  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000626898  hitchhiker  0.00075643 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2858  hypothetical protein  40.17 
 
 		 181 aa  47.4  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000291416 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2148  calcium-binding EF-hand-containing protein  49.02 
 
 		 143 aa  45.4  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  38.6 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  38.6 
 
 		 205 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1553  hypothetical protein  53.33 
 
 		 97 aa  43.9  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.320055 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3374  hypothetical protein  57.5 
 
 		 67 aa  43.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.680561  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  39.66 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1950  signal transduction protein  37.33 
 
 		 112 aa  42  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.598252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1009  calcium-binding EF-hand  28.02 
 
 		 201 aa  42  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1776  hypothetical protein  37.5 
 
 		 120 aa  42  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.597953  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3095  hypothetical protein  38.38 
 
 		 98 aa  40.8  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>