26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0988 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0988  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  305  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2002  hypothetical protein  65.99 
 
 		 146 aa  189  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2853  hypothetical protein  53.18 
 
 		 173 aa  171  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.652841  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2397  EF hand domain-containing protein  60.12 
 
 		 218 aa  167  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3298  hypothetical protein  59.51 
 
 		 218 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4832  hypothetical protein  54.23 
 
 		 135 aa  144  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.128133  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2260  hypothetical protein  38.13 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00464022  normal  0.48524 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2007  hypothetical protein  35.66 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2621  hypothetical protein  36.43 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00231504  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2696  hypothetical protein  36.43 
 
 		 142 aa  51.2  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2580  hypothetical protein  35.71 
 
 		 143 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0433297  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1763  hypothetical protein  35.71 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00142931  hitchhiker  0.00932404 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1009  calcium-binding EF-hand  40.85 
 
 		 201 aa  47.4  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1304  hypothetical protein  40 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.281387  normal  0.0615794 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0223  hypothetical protein  46.94 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.893261  normal  0.0721241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2332  hypothetical protein  36.36 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00550245  hitchhiker  0.00911187 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3380  signal transduction protein  33.33 
 
 		 209 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1502  hypothetical protein  44.74 
 
 		 160 aa  44.3  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.387853  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0112  acid shock protein-like  51.02 
 
 		 126 aa  43.9  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.51175 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1629  signal transduction protein  28.83 
 
 		 170 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2387  hypothetical protein  42.11 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000879292  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2148  calcium-binding EF-hand-containing protein  48 
 
 		 143 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  36.84 
 
 		 205 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  36.84 
 
 		 205 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2551  hypothetical protein  40.32 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0760261  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2451  hypothetical protein  32.73 
 
 		 143 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0669887  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>