28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2580 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_2580  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  265  1e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0433297  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1763  hypothetical protein  99.3 
 
 
143 aa  264  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00142931  hitchhiker  0.00932404 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2621  hypothetical protein  98.6 
 
 
143 aa  263  8e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00231504  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2696  hypothetical protein  97.2 
 
 
142 aa  236  9e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2260  hypothetical protein  88.81 
 
 
143 aa  221  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00464022  normal  0.48524 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2007  hypothetical protein  83.92 
 
 
143 aa  201  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2332  hypothetical protein  87.41 
 
 
143 aa  196  7e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00550245  hitchhiker  0.00911187 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2451  hypothetical protein  86.01 
 
 
143 aa  171  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0669887  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2858  hypothetical protein  51.85 
 
 
181 aa  128  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000291416 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1502  hypothetical protein  59.69 
 
 
160 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.387853  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1304  hypothetical protein  61.19 
 
 
147 aa  127  6e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.281387  normal  0.0615794 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2241  hypothetical protein  57.25 
 
 
146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000626898  hitchhiker  0.00075643 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2308  hypothetical protein  80.95 
 
 
136 aa  114  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0781022  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2387  hypothetical protein  54.26 
 
 
120 aa  102  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000879292  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2413  hypothetical protein  66.15 
 
 
142 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0124619  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1787  hypothetical protein  67.21 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000888061 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1776  hypothetical protein  44.09 
 
 
120 aa  63.9  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.597953  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21570  hypothetical protein  39.52 
 
 
104 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1836  hypothetical protein  38.46 
 
 
104 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3152  hypothetical protein  41.27 
 
 
110 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.117538  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0988  hypothetical protein  35.71 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2636  hypothetical protein  35.09 
 
 
117 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.82206  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01093  hypothetical protein  50.94 
 
 
164 aa  52.4  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.183403  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2853  hypothetical protein  32.67 
 
 
173 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.652841  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1553  hypothetical protein  36.59 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.320055 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2002  hypothetical protein  34.56 
 
 
146 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3107  hypothetical protein  35.11 
 
 
107 aa  44.3  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2901  hypothetical protein  40.48 
 
 
157 aa  42  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>