25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1553 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1553  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  183  8e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.320055 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21570  hypothetical protein  54.21 
 
 		 104 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1836  hypothetical protein  52.34 
 
 		 104 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1502  hypothetical protein  45.45 
 
 		 160 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.387853  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2387  hypothetical protein  47.06 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000879292  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2241  hypothetical protein  51.04 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000626898  hitchhiker  0.00075643 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2858  hypothetical protein  46.53 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000291416 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1304  hypothetical protein  48.21 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.281387  normal  0.0615794 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2002  hypothetical protein  53.95 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2696  hypothetical protein  41.74 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2580  hypothetical protein  40.68 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0433297  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1763  hypothetical protein  40.68 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00142931  hitchhiker  0.00932404 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2621  hypothetical protein  40.52 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00231504  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2260  hypothetical protein  40.68 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00464022  normal  0.48524 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2007  hypothetical protein  42.24 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2332  hypothetical protein  43.1 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00550245  hitchhiker  0.00911187 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3152  hypothetical protein  41.51 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.117538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2853  hypothetical protein  44.71 
 
 		 173 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.652841  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3107  hypothetical protein  40 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2636  hypothetical protein  36.28 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.82206  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0988  hypothetical protein  45.98 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3298  hypothetical protein  59.14 
 
 		 218 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2397  EF hand domain-containing protein  59.14 
 
 		 218 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01093  hypothetical protein  44.44 
 
 		 164 aa  40  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.183403  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2451  hypothetical protein  41.3 
 
 		 143 aa  40  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0669887  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>