20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3152 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3152  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  208  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.117538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1836  hypothetical protein  49.09 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21570  hypothetical protein  49.09 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1502  hypothetical protein  40.48 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.387853  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2241  hypothetical protein  41.23 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000626898  hitchhiker  0.00075643 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2387  hypothetical protein  38.46 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000879292  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2696  hypothetical protein  40.8 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2260  hypothetical protein  41.27 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00464022  normal  0.48524 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2580  hypothetical protein  41.27 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0433297  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1763  hypothetical protein  41.27 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00142931  hitchhiker  0.00932404 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2621  hypothetical protein  40.48 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00231504  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2858  hypothetical protein  38.21 
 
 		 181 aa  52.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000291416 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2332  hypothetical protein  39.69 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00550245  hitchhiker  0.00911187 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1553  hypothetical protein  42.86 
 
 		 97 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.320055 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2007  hypothetical protein  36.51 
 
 		 143 aa  47  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1304  hypothetical protein  39.8 
 
 		 147 aa  47  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.281387  normal  0.0615794 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2451  hypothetical protein  35.14 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0669887  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3107  hypothetical protein  39.58 
 
 		 107 aa  45.1  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0290  hypothetical protein  55.81 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1009  calcium-binding EF-hand  45.45 
 
 		 201 aa  40.4  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>