18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1009 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1009  calcium-binding EF-hand  100 
 
 
201 aa  404  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2551  hypothetical protein  35.29 
 
 
137 aa  84  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0760261  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2002  hypothetical protein  32.62 
 
 
146 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4832  hypothetical protein  36.79 
 
 
135 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.128133  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1836  hypothetical protein  42.71 
 
 
104 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21570  hypothetical protein  42.71 
 
 
104 aa  52  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0988  hypothetical protein  33.33 
 
 
154 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2636  hypothetical protein  35.14 
 
 
117 aa  48.9  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.82206  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2148  calcium-binding EF-hand-containing protein  34.15 
 
 
143 aa  48.1  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3152  hypothetical protein  37.76 
 
 
110 aa  47.4  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.117538  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2853  hypothetical protein  26.9 
 
 
173 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.652841  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  44.64 
 
 
205 aa  45.1  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  44.64 
 
 
205 aa  45.1  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3545  signal transduction protein  46.15 
 
 
209 aa  44.3  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000138612  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3380  signal transduction protein  47.27 
 
 
209 aa  43.9  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03729  1,3-beta-D-glucan synthase catalytic subunitPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q92225]  31.17 
 
 
1905 aa  43.5  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.789919 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2165  hypothetical protein  47.62 
 
 
68 aa  42.4  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  47.83 
 
 
190 aa  41.6  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>