75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3380 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3380  signal transduction protein  100 
 
 		 209 aa  422  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  66.48 
 
 		 190 aa  201  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  40.49 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  40.98 
 
 		 205 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  43.37 
 
 		 194 aa  124  8.000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2469  putative signal transduction protein with EFhand domain  35.79 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1110  hypothetical protein  34.23 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.124565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3579  calcium-binding EF-hand  41.89 
 
 		 122 aa  57  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.56179  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0081  Calcium-binding EF-hand-containing protein  34.53 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2724  calcium-binding EF-hand  44.12 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5773  hypothetical protein  45.31 
 
 		 109 aa  53.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0389  hypothetical protein  40.98 
 
 		 131 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0896126  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2059a  hypothetical protein  39.68 
 
 		 105 aa  52.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1629  signal transduction protein  45.12 
 
 		 170 aa  52  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5853  hypothetical protein  38.1 
 
 		 96 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.502913  normal  0.827274 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0950  signal transduction protein  32.14 
 
 		 242 aa  50.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04858  EF hand domain protein  28.66 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.269364  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2405  hypothetical protein  38.33 
 
 		 97 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4832  hypothetical protein  44 
 
 		 135 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.128133  normal  0.25811 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02173  calcium-dependent mitochondrial carrier protein, putative (Eurofung)  32.63 
 
 		 580 aa  48.9  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00497794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2235  calcium-binding domain-containing protein  35.04 
 
 		 118 aa  48.5  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.538566  normal  0.506207 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1843  acid-shock protein  32.45 
 
 		 177 aa  48.5  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.147127  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1482  acid-shock protein  28.3 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1266  calcium-binding EF-hand-containing protein  29.79 
 
 		 167 aa  47.8  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.567  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0440  calcium-binding EF-hand protein  29.27 
 
 		 226 aa  47.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0765893  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5705  calcium-binding EF-hand-containing protein  43.94 
 
 		 154 aa  47.4  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0268873  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0450  hypothetical protein  51.92 
 
 		 266 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31546  predicted protein  33.68 
 
 		 546 aa  46.2  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.133549 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3284  signal transduction protein  31.53 
 
 		 139 aa  46.6  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0725465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0984  hypothetical protein  35.09 
 
 		 87 aa  46.6  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1296  putative acid-shock protein  45.61 
 
 		 179 aa  45.8  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00317  EF hand domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G02540)  31.03 
 
 		 1258 aa  46.2  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0655  signal transduction protein  33.7 
 
 		 184 aa  46.2  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1336  acid-shock protein, putative  45.61 
 
 		 184 aa  46.2  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14031  hypothetical protein  28.97 
 
 		 171 aa  45.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.10797 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1009  calcium-binding EF-hand  43.1 
 
 		 201 aa  45.8  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0416  calcium-binding EF-hand domain-containing protein  36.27 
 
 		 218 aa  45.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3938  calcium-binding EF-hand-containing protein  32.95 
 
 		 202 aa  45.8  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3600  calcium-binding EF-hand-containing protein  32.95 
 
 		 202 aa  45.8  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.799604  normal  0.113193 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45986  predicted protein  27.88 
 
 		 149 aa  45.1  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4161  Calcium-binding EF-hand-containing protein  32.74 
 
 		 139 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3224  hypothetical protein  30.51 
 
 		 209 aa  45.1  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.916377  normal  0.185991 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0988  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2397  EF hand domain-containing protein  37.84 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2384  hypothetical protein  28.35 
 
 		 163 aa  44.3  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190826 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5866  hypothetical protein  48.98 
 
 		 137 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.91114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3976  signal transduction protein  42.42 
 
 		 149 aa  44.3  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.895273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2148  calcium-binding EF-hand-containing protein  33.06 
 
 		 143 aa  44.3  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4301  calcium-binding EF-hand-containing protein  36.08 
 
 		 151 aa  44.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.699333  normal  0.0950575 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3298  hypothetical protein  37.84 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0133  hypothetical protein  36.67 
 
 		 133 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.165134  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4199  signal transduction protein  29.29 
 
 		 282 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0064  Calcium-binding EF-hand-containing protein  38.96 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.916763  normal  0.014453 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2073  signal transduction protein  35.29 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0851765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5798  Calcium-binding EF-hand-containing protein  32.14 
 
 		 97 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0616  hypothetical protein  36.67 
 
 		 133 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.642122  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3545  signal transduction protein  32.94 
 
 		 209 aa  43.5  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000138612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3230  signal transduction protein  46.3 
 
 		 99 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.263542 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3135  calcium-binding EF-hand  33.33 
 
 		 164 aa  43.1  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.850385  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2893  Calcium-binding EF-hand-containing protein  26.11 
 
 		 189 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.815095 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0833  Calcium-binding EF-hand-containing protein  53.33 
 
 		 135 aa  43.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0359291  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1585  hypothetical protein  38.89 
 
 		 263 aa  42.7  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4425  hypothetical protein  29.2 
 
 		 139 aa  42.4  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1114  hypothetical protein  31.71 
 
 		 153 aa  42.4  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0883796 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2178  hypothetical protein  35.23 
 
 		 167 aa  42.4  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0312897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0584  hypothetical protein  35 
 
 		 132 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.506035  hitchhiker  0.00941116 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3604  signal transduction protein  30 
 
 		 137 aa  42.4  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0412957  hitchhiker  0.00158231 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2496  hypothetical protein  31.17 
 
 		 186 aa  42  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04140  conserved hypothetical protein  26.27 
 
 		 390 aa  42  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.468801  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1833  hypothetical protein  31.46 
 
 		 155 aa  41.6  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.524145 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17199  2-phosphoglycolate phosphatase  32.38 
 
 		 517 aa  41.6  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.493472  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2002  hypothetical protein  34.67 
 
 		 146 aa  41.6  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2853  hypothetical protein  32.93 
 
 		 173 aa  41.6  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.652841  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0112  acid shock protein-like  40.74 
 
 		 126 aa  41.6  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.51175 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4339  putative signal transduction protein with EFhand domain  37.5 
 
 		 256 aa  41.2  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.1378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>