25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1304 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1304  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  261  3e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.281387  normal  0.0615794 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2858  hypothetical protein  63.31 
 
 		 181 aa  155  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000291416 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2241  hypothetical protein  64.67 
 
 		 146 aa  137  6e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000626898  hitchhiker  0.00075643 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1502  hypothetical protein  65.19 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.387853  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2696  hypothetical protein  62.69 
 
 		 142 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2260  hypothetical protein  62.69 
 
 		 143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00464022  normal  0.48524 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2621  hypothetical protein  61.19 
 
 		 143 aa  130  6e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00231504  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2580  hypothetical protein  61.19 
 
 		 143 aa  130  6e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0433297  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1763  hypothetical protein  61.19 
 
 		 143 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00142931  hitchhiker  0.00932404 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2007  hypothetical protein  64.71 
 
 		 143 aa  128  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2332  hypothetical protein  57.46 
 
 		 143 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00550245  hitchhiker  0.00911187 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2387  hypothetical protein  60 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000879292  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2451  hypothetical protein  62.39 
 
 		 143 aa  99.4  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0669887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2308  hypothetical protein  77.97 
 
 		 136 aa  99  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0781022  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1787  hypothetical protein  72.09 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000888061 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2413  hypothetical protein  61.9 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0124619  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2636  hypothetical protein  35.96 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.82206  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1836  hypothetical protein  45 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21570  hypothetical protein  44 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1776  hypothetical protein  42.59 
 
 		 120 aa  52.8  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.597953  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01093  hypothetical protein  50 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.183403  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3152  hypothetical protein  41.05 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.117538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2002  hypothetical protein  42.5 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0988  hypothetical protein  42.57 
 
 		 154 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1553  hypothetical protein  44.07 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.320055 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>