28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2387 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2387  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  223  6e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000879292  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1502  hypothetical protein  67.74 
 
 		 160 aa  134  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.387853  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1304  hypothetical protein  60 
 
 		 147 aa  123  9e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.281387  normal  0.0615794 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2696  hypothetical protein  61.72 
 
 		 142 aa  122  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2260  hypothetical protein  62.79 
 
 		 143 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00464022  normal  0.48524 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2621  hypothetical protein  60.77 
 
 		 143 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00231504  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1763  hypothetical protein  60 
 
 		 143 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00142931  hitchhiker  0.00932404 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2241  hypothetical protein  60.32 
 
 		 146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000626898  hitchhiker  0.00075643 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2007  hypothetical protein  62.5 
 
 		 143 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2580  hypothetical protein  59.23 
 
 		 143 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0433297  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2858  hypothetical protein  59.69 
 
 		 181 aa  107  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000291416 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2332  hypothetical protein  50.41 
 
 		 143 aa  97.8  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00550245  hitchhiker  0.00911187 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2451  hypothetical protein  50 
 
 		 143 aa  88.2  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0669887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2413  hypothetical protein  83.72 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0124619  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2308  hypothetical protein  60 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0781022  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3152  hypothetical protein  40.48 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.117538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21570  hypothetical protein  41.32 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1836  hypothetical protein  40.5 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1787  hypothetical protein  54.76 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000888061 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01093  hypothetical protein  51.92 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.183403  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2636  hypothetical protein  40 
 
 		 117 aa  51.2  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.82206  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0988  hypothetical protein  46.81 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2901  hypothetical protein  61.95 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2853  hypothetical protein  43.68 
 
 		 173 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.652841  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1553  hypothetical protein  37.04 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.320055 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2002  hypothetical protein  41.86 
 
 		 146 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1776  hypothetical protein  50.96 
 
 		 120 aa  45.1  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.597953  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3095  hypothetical protein  41.9 
 
 		 98 aa  42  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>