28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2260 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2260  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  265  1e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00464022  normal  0.48524 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2332  hypothetical protein  98.6 
 
 		 143 aa  262  1e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00550245  hitchhiker  0.00911187 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2621  hypothetical protein  89.51 
 
 		 143 aa  222  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00231504  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2580  hypothetical protein  88.81 
 
 		 143 aa  221  3e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0433297  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2696  hypothetical protein  90.21 
 
 		 142 aa  221  4e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1763  hypothetical protein  88.81 
 
 		 143 aa  220  6e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00142931  hitchhiker  0.00932404 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2007  hypothetical protein  88.11 
 
 		 143 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2451  hypothetical protein  69.7 
 
 		 143 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0669887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1304  hypothetical protein  62.69 
 
 		 147 aa  128  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.281387  normal  0.0615794 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1502  hypothetical protein  59.69 
 
 		 160 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.387853  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2241  hypothetical protein  60.87 
 
 		 146 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000626898  hitchhiker  0.00075643 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2858  hypothetical protein  51.85 
 
 		 181 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000291416 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2308  hypothetical protein  80.91 
 
 		 136 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0781022  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2387  hypothetical protein  56.25 
 
 		 120 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000879292  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2413  hypothetical protein  67.69 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0124619  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1787  hypothetical protein  72.13 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000888061 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1776  hypothetical protein  56.25 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.597953  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21570  hypothetical protein  40.32 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1836  hypothetical protein  40.32 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3152  hypothetical protein  46.67 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.117538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0988  hypothetical protein  38.13 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01093  hypothetical protein  48.08 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.183403  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2636  hypothetical protein  35.09 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.82206  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2853  hypothetical protein  31.33 
 
 		 173 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.652841  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2901  hypothetical protein  52.38 
 
 		 157 aa  51.2  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2002  hypothetical protein  37.25 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1553  hypothetical protein  36.49 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.320055 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0670  hypothetical protein  31.3 
 
 		 158 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.217425  decreased coverage  0.0000800314 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>