31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1502 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_1502  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  280  7.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.387853  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2858  hypothetical protein  65.58 
 
 
181 aa  151  5e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000291416 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2241  hypothetical protein  65.58 
 
 
146 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000626898  hitchhiker  0.00075643 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1304  hypothetical protein  64.43 
 
 
147 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.281387  normal  0.0615794 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2621  hypothetical protein  60.47 
 
 
143 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00231504  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1763  hypothetical protein  59.69 
 
 
143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00142931  hitchhiker  0.00932404 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2696  hypothetical protein  60.16 
 
 
142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2580  hypothetical protein  58.91 
 
 
143 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0433297  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2260  hypothetical protein  55.56 
 
 
143 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00464022  normal  0.48524 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2007  hypothetical protein  61.24 
 
 
143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2387  hypothetical protein  67.21 
 
 
120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000879292  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2332  hypothetical protein  49.61 
 
 
143 aa  97.8  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00550245  hitchhiker  0.00911187 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2451  hypothetical protein  55.14 
 
 
143 aa  89  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0669887  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2308  hypothetical protein  58.73 
 
 
136 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0781022  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1787  hypothetical protein  70.49 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000888061 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3152  hypothetical protein  39.53 
 
 
110 aa  67.8  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.117538  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1836  hypothetical protein  45.05 
 
 
104 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21570  hypothetical protein  45.05 
 
 
104 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2002  hypothetical protein  44.32 
 
 
146 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01093  hypothetical protein  47.17 
 
 
164 aa  50.8  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.183403  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2853  hypothetical protein  37.7 
 
 
173 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.652841  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1100  hypothetical protein  33.33 
 
 
377 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.303009  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2636  hypothetical protein  30.97 
 
 
117 aa  48.9  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.82206  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2413  hypothetical protein  40.48 
 
 
142 aa  48.9  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0124619  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1776  hypothetical protein  45.83 
 
 
120 aa  48.5  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.597953  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3095  hypothetical protein  43.82 
 
 
98 aa  47.8  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3107  hypothetical protein  41.46 
 
 
107 aa  47.4  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2901  hypothetical protein  47.62 
 
 
157 aa  45.1  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2360  hypothetical protein  29.21 
 
 
187 aa  44.7  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1553  hypothetical protein  36.99 
 
 
97 aa  43.9  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.320055 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0988  hypothetical protein  44.74 
 
 
154 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>