29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2397 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2397  EF hand domain-containing protein  100 
 
 		 218 aa  448  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3298  hypothetical protein  97.71 
 
 		 218 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2002  hypothetical protein  76.83 
 
 		 146 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0988  hypothetical protein  63.8 
 
 		 154 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2853  hypothetical protein  59.17 
 
 		 173 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.652841  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4832  hypothetical protein  50.32 
 
 		 135 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.128133  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1502  hypothetical protein  49.06 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.387853  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2260  hypothetical protein  45.28 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00464022  normal  0.48524 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1304  hypothetical protein  48.94 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.281387  normal  0.0615794 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2696  hypothetical protein  44.04 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2858  hypothetical protein  39.26 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000291416 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2387  hypothetical protein  44.76 
 
 		 120 aa  54.7  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000879292  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21570  hypothetical protein  48.84 
 
 		 104 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1553  hypothetical protein  50.79 
 
 		 97 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.320055 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2241  hypothetical protein  40.71 
 
 		 146 aa  52.4  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000626898  hitchhiker  0.00075643 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2007  hypothetical protein  39.53 
 
 		 143 aa  51.6  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1836  hypothetical protein  44.44 
 
 		 104 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3380  signal transduction protein  33.33 
 
 		 209 aa  48.9  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  42.11 
 
 		 205 aa  45.4  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  42.11 
 
 		 205 aa  45.1  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2621  hypothetical protein  38.35 
 
 		 143 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00231504  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2451  hypothetical protein  35.64 
 
 		 143 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0669887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1009  calcium-binding EF-hand  29.94 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2551  hypothetical protein  41.18 
 
 		 137 aa  43.5  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0760261  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1306  hypothetical protein  37.61 
 
 		 118 aa  43.5  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.202527 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0223  hypothetical protein  41.18 
 
 		 140 aa  42.7  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.893261  normal  0.0721241 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1776  hypothetical protein  37.23 
 
 		 120 aa  42.4  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.597953  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  30.85 
 
 		 190 aa  42.4  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  41.38 
 
 		 194 aa  42  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>