23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0223 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0223  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  278  3e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.893261  normal  0.0721241 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4425  hypothetical protein  42.98 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3604  signal transduction protein  38.1 
 
 		 137 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0412957  hitchhiker  0.00158231 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4161  Calcium-binding EF-hand-containing protein  41.74 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4301  calcium-binding EF-hand-containing protein  39.64 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.699333  normal  0.0950575 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0823  hypothetical protein  38.83 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.112496 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0271  Calcium-binding EF-hand-containing protein  37.4 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0508826 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2235  calcium-binding domain-containing protein  39.29 
 
 		 118 aa  72  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.538566  normal  0.506207 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1805  putative signal transduction protein with EFhand domain  37 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.537311 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2189  putative signal transduction protein with EFhand domain  36 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.350959  normal  0.155575 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1854  hypothetical protein  36 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8024  Calcium-binding EF-hand-containing protein  39 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2815  hypothetical protein  36.27 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11305  normal  0.1713 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1986  putative signal peptide protein  36.47 
 
 		 122 aa  57  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2384  hypothetical protein  29.85 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190826 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5990  putative signal peptide protein  32.97 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0988  hypothetical protein  46.94 
 
 		 154 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  28.46 
 
 		 194 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3298  hypothetical protein  41.18 
 
 		 218 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2002  hypothetical protein  43.14 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2397  EF hand domain-containing protein  41.18 
 
 		 218 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1867  calcium-binding protein  26.47 
 
 		 148 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  33.63 
 
 		 190 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>