26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1867 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_6104  calcium-binding protein  99.32 
 
 
188 aa  280  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1867  calcium-binding protein  100 
 
 
148 aa  279  7.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0835  EF hand domain protein  42.02 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3148  hypothetical protein  37.25 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3064  hypothetical protein  40.68 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.435361  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3284  signal transduction protein  35.29 
 
 
139 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0725465  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0488  calcium-binding EF-hand  31.08 
 
 
155 aa  52  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0133587  normal  0.146102 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3184  calcium-binding EF-hand-containing protein  33.33 
 
 
225 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53519  normal  0.491229 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1482  acid-shock protein  31.2 
 
 
188 aa  49.7  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2384  hypothetical protein  27.74 
 
 
163 aa  48.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190826 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0450  hypothetical protein  43.28 
 
 
266 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3604  signal transduction protein  28.1 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0412957  hitchhiker  0.00158231 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5252  putative signal transduction protein with EFhand domain  31.45 
 
 
292 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.849425 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4161  Calcium-binding EF-hand-containing protein  27.97 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0416  calcium-binding EF-hand domain-containing protein  33.93 
 
 
218 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4425  hypothetical protein  27.74 
 
 
139 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0064  Calcium-binding EF-hand-containing protein  26.14 
 
 
213 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.916763  normal  0.014453 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2073  signal transduction protein  33.04 
 
 
212 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0851765  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1986  putative signal peptide protein  30.94 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534123  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0081  Calcium-binding EF-hand-containing protein  26.85 
 
 
212 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4301  calcium-binding EF-hand-containing protein  28.83 
 
 
151 aa  41.6  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.699333  normal  0.0950575 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0950  signal transduction protein  30.88 
 
 
242 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  30 
 
 
190 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3135  calcium-binding EF-hand  31.21 
 
 
164 aa  41.6  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.850385  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1805  putative signal transduction protein with EFhand domain  27.93 
 
 
133 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.537311 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0946  hypothetical protein  31.45 
 
 
198 aa  40.4  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.587997  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>