33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4161 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4161  Calcium-binding EF-hand-containing protein  100 
 
 		 139 aa  263  5e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4425  hypothetical protein  76.81 
 
 		 139 aa  197  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4301  calcium-binding EF-hand-containing protein  71.17 
 
 		 151 aa  154  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.699333  normal  0.0950575 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1805  putative signal transduction protein with EFhand domain  65.05 
 
 		 133 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.537311 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3604  signal transduction protein  55.04 
 
 		 137 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0412957  hitchhiker  0.00158231 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2189  putative signal transduction protein with EFhand domain  65.05 
 
 		 133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.350959  normal  0.155575 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1854  hypothetical protein  65.05 
 
 		 133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2235  calcium-binding domain-containing protein  60 
 
 		 118 aa  124  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.538566  normal  0.506207 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8024  Calcium-binding EF-hand-containing protein  53.24 
 
 		 134 aa  114  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0823  hypothetical protein  53.4 
 
 		 138 aa  100  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.112496 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0271  Calcium-binding EF-hand-containing protein  43.85 
 
 		 130 aa  87.8  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0508826 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2815  hypothetical protein  43.48 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11305  normal  0.1713 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0223  hypothetical protein  41.96 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.893261  normal  0.0721241 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1986  putative signal peptide protein  31.58 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03592  EF hand domain protein  31.43 
 
 		 112 aa  50.8  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.306427  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3938  calcium-binding EF-hand-containing protein  41.46 
 
 		 202 aa  50.1  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3600  calcium-binding EF-hand-containing protein  41.46 
 
 		 202 aa  50.1  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.799604  normal  0.113193 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  35.04 
 
 		 205 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  35.04 
 
 		 205 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2148  calcium-binding EF-hand-containing protein  30.71 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0043  hypothetical protein  27.05 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0382289 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1867  calcium-binding protein  27.97 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5990  putative signal peptide protein  22.88 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6104  calcium-binding protein  27.97 
 
 		 188 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3380  signal transduction protein  32.74 
 
 		 209 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0488  calcium-binding EF-hand  25.53 
 
 		 155 aa  44.7  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0133587  normal  0.146102 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1266  calcium-binding EF-hand-containing protein  31.54 
 
 		 167 aa  43.9  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.567  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0139  hypothetical protein  26.81 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0820746  normal  0.13795 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3148  hypothetical protein  29.86 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2178  hypothetical protein  40 
 
 		 167 aa  42  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0312897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32593  predicted protein  27.97 
 
 		 350 aa  41.2  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0289606 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0346  Calcium-binding EF-hand-containing protein  44 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0991  calcium-binding EF-hand-containing protein  27.78 
 
 		 194 aa  40  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0245104  normal  0.296766 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>