26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03592 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03592  EF hand domain protein  100 
 
 		 112 aa  228  2e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.306427  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0043  hypothetical protein  61.68 
 
 		 110 aa  129  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0382289 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2178  hypothetical protein  36.61 
 
 		 167 aa  58.2  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0312897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2148  calcium-binding EF-hand-containing protein  30.53 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  39.29 
 
 		 194 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  40.7 
 
 		 205 aa  53.9  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  39.53 
 
 		 205 aa  52.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4301  calcium-binding EF-hand-containing protein  34.02 
 
 		 151 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.699333  normal  0.0950575 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3604  signal transduction protein  32.74 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0412957  hitchhiker  0.00158231 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4161  Calcium-binding EF-hand-containing protein  31.43 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4425  hypothetical protein  28 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1805  putative signal transduction protein with EFhand domain  34.44 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.537311 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1854  hypothetical protein  32.22 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2189  putative signal transduction protein with EFhand domain  32.22 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.350959  normal  0.155575 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2341  signal transduction protein  41.18 
 
 		 124 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00164807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1986  putative signal peptide protein  35.29 
 
 		 122 aa  44.3  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4199  signal transduction protein  35.63 
 
 		 282 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1110  hypothetical protein  33.64 
 
 		 187 aa  43.9  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.124565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3938  calcium-binding EF-hand-containing protein  30.86 
 
 		 202 aa  43.9  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3600  calcium-binding EF-hand-containing protein  30.86 
 
 		 202 aa  43.9  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.799604  normal  0.113193 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  36.14 
 
 		 190 aa  43.5  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2235  calcium-binding domain-containing protein  31.91 
 
 		 118 aa  42.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.538566  normal  0.506207 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0488  calcium-binding EF-hand  30.7 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0133587  normal  0.146102 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1266  calcium-binding EF-hand-containing protein  33.61 
 
 		 167 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.567  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0416  calcium-binding EF-hand domain-containing protein  40.24 
 
 		 218 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1228  signal transduction protein  31.11 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522863  normal  0.321089 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>