27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3604 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3604  signal transduction protein  100 
 
 		 137 aa  268  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0412957  hitchhiker  0.00158231 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4425  hypothetical protein  56.72 
 
 		 139 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4301  calcium-binding EF-hand-containing protein  65.38 
 
 		 151 aa  138  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.699333  normal  0.0950575 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1805  putative signal transduction protein with EFhand domain  66.02 
 
 		 133 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.537311 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2189  putative signal transduction protein with EFhand domain  64.08 
 
 		 133 aa  130  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.350959  normal  0.155575 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1854  hypothetical protein  64.08 
 
 		 133 aa  130  5e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4161  Calcium-binding EF-hand-containing protein  55.04 
 
 		 139 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2235  calcium-binding domain-containing protein  58.82 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.538566  normal  0.506207 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0823  hypothetical protein  50 
 
 		 138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.112496 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8024  Calcium-binding EF-hand-containing protein  57.03 
 
 		 134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0271  Calcium-binding EF-hand-containing protein  42.34 
 
 		 130 aa  96.3  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0508826 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2815  hypothetical protein  38.64 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11305  normal  0.1713 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0223  hypothetical protein  38.39 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.893261  normal  0.0721241 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03592  EF hand domain protein  32.74 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.306427  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1986  putative signal peptide protein  27.59 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0043  hypothetical protein  30.17 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0382289 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6104  calcium-binding protein  27.78 
 
 		 188 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1867  calcium-binding protein  28.1 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3284  signal transduction protein  31.37 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0725465  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5990  putative signal peptide protein  30.49 
 
 		 119 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  34.83 
 
 		 14609 aa  45.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  31.86 
 
 		 190 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3380  signal transduction protein  29.82 
 
 		 209 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32593  predicted protein  36.71 
 
 		 350 aa  42  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0289606 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  30.33 
 
 		 205 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0488  calcium-binding EF-hand  28.12 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0133587  normal  0.146102 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  31.19 
 
 		 205 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>