20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5990 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012852  Rleg_5990  putative signal peptide protein  100 
 
 		 119 aa  245  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1986  putative signal peptide protein  50.82 
 
 		 122 aa  120  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0271  Calcium-binding EF-hand-containing protein  30.56 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0508826 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1110  hypothetical protein  36.17 
 
 		 187 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.124565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4161  Calcium-binding EF-hand-containing protein  22.88 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0757  hypothetical protein  36.71 
 
 		 203 aa  47.8  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3284  signal transduction protein  26.77 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0725465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2235  calcium-binding domain-containing protein  28.05 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.538566  normal  0.506207 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1805  putative signal transduction protein with EFhand domain  30.49 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.537311 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3604  signal transduction protein  26.36 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0412957  hitchhiker  0.00158231 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4425  hypothetical protein  26.83 
 
 		 139 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2469  putative signal transduction protein with EFhand domain  28.57 
 
 		 125 aa  43.9  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4301  calcium-binding EF-hand-containing protein  28.05 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.699333  normal  0.0950575 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1854  hypothetical protein  28.05 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2189  putative signal transduction protein with EFhand domain  28.05 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.350959  normal  0.155575 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0823  hypothetical protein  26.83 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.112496 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03592  EF hand domain protein  31.43 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.306427  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0440  calcium-binding EF-hand protein  36.36 
 
 		 226 aa  40.8  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0765893  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8024  Calcium-binding EF-hand-containing protein  28.05 
 
 		 134 aa  40.4  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04858  EF hand domain protein  31.67 
 
 		 193 aa  40  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.269364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>