22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2189 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1854  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  253  5e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2189  putative signal transduction protein with EFhand domain  100 
 
 		 133 aa  253  5e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.350959  normal  0.155575 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1805  putative signal transduction protein with EFhand domain  97.74 
 
 		 133 aa  202  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.537311 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3604  signal transduction protein  56.2 
 
 		 137 aa  137  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0412957  hitchhiker  0.00158231 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4301  calcium-binding EF-hand-containing protein  56.59 
 
 		 151 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.699333  normal  0.0950575 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4425  hypothetical protein  55 
 
 		 139 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4161  Calcium-binding EF-hand-containing protein  56.72 
 
 		 139 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2235  calcium-binding domain-containing protein  59.65 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.538566  normal  0.506207 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8024  Calcium-binding EF-hand-containing protein  60.16 
 
 		 134 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0271  Calcium-binding EF-hand-containing protein  51.13 
 
 		 130 aa  120  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0508826 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0823  hypothetical protein  48.84 
 
 		 138 aa  99.4  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.112496 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2815  hypothetical protein  40.91 
 
 		 139 aa  81.3  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11305  normal  0.1713 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1986  putative signal peptide protein  29.36 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0043  hypothetical protein  31.45 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0382289 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0223  hypothetical protein  31.3 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.893261  normal  0.0721241 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03592  EF hand domain protein  30.77 
 
 		 112 aa  51.6  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.306427  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2148  calcium-binding EF-hand-containing protein  30.66 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0757  hypothetical protein  32.97 
 
 		 203 aa  47.4  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5990  putative signal peptide protein  25.66 
 
 		 119 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  35.85 
 
 		 1394 aa  44.3  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6104  calcium-binding protein  26.45 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1228  signal transduction protein  33.73 
 
 		 145 aa  40.4  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522863  normal  0.321089 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>