25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_6104 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_6104  calcium-binding protein  100 
 
 		 188 aa  368  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1867  calcium-binding protein  99.32 
 
 		 148 aa  280  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0835  EF hand domain protein  41.27 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3148  hypothetical protein  36.13 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3064  hypothetical protein  40.68 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3284  signal transduction protein  36.13 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0725465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0488  calcium-binding EF-hand  31.76 
 
 		 155 aa  53.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0133587  normal  0.146102 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3184  calcium-binding EF-hand-containing protein  33.33 
 
 		 225 aa  52  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53519  normal  0.491229 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1482  acid-shock protein  30.58 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2384  hypothetical protein  27.74 
 
 		 163 aa  48.5  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190826 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3604  signal transduction protein  27.78 
 
 		 137 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0412957  hitchhiker  0.00158231 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0450  hypothetical protein  43.28 
 
 		 266 aa  47.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5252  putative signal transduction protein with EFhand domain  30.82 
 
 		 292 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.849425 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4161  Calcium-binding EF-hand-containing protein  27.97 
 
 		 139 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0064  Calcium-binding EF-hand-containing protein  25.49 
 
 		 213 aa  45.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.916763  normal  0.014453 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0416  calcium-binding EF-hand domain-containing protein  33.33 
 
 		 218 aa  45.1  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4425  hypothetical protein  26.67 
 
 		 139 aa  44.7  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2073  signal transduction protein  32.46 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0851765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0950  signal transduction protein  30.88 
 
 		 242 aa  42.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1986  putative signal peptide protein  30.94 
 
 		 122 aa  42.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0081  Calcium-binding EF-hand-containing protein  26.85 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4301  calcium-binding EF-hand-containing protein  28.83 
 
 		 151 aa  42.4  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.699333  normal  0.0950575 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  30 
 
 		 190 aa  42.4  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3135  calcium-binding EF-hand  31.21 
 
 		 164 aa  42  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.850385  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0946  hypothetical protein  31.45 
 
 		 198 aa  42  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.587997  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>