13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3064 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3064  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  289  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3148  hypothetical protein  76.76 
 
 		 143 aa  222  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0835  EF hand domain protein  62.68 
 
 		 144 aa  176  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1867  calcium-binding protein  40.58 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6104  calcium-binding protein  39.86 
 
 		 188 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0488  calcium-binding EF-hand  32.14 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0133587  normal  0.146102 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2073  signal transduction protein  32.73 
 
 		 212 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0851765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0416  calcium-binding EF-hand domain-containing protein  31.82 
 
 		 218 aa  50.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2384  hypothetical protein  26.71 
 
 		 163 aa  49.7  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190826 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0946  hypothetical protein  32.52 
 
 		 198 aa  48.1  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.587997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2633  EF hand domain-containing protein  32.54 
 
 		 147 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202488  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3284  signal transduction protein  29.63 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0725465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1114  hypothetical protein  29.66 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0883796 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>