20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0946 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0946  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  390  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.587997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6104  calcium-binding protein  31.55 
 
 		 188 aa  52.4  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0064  Calcium-binding EF-hand-containing protein  32.18 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.916763  normal  0.014453 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3064  hypothetical protein  33.87 
 
 		 144 aa  52  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1867  calcium-binding protein  31.55 
 
 		 148 aa  51.2  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0450  hypothetical protein  48.98 
 
 		 266 aa  51.2  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0081  Calcium-binding EF-hand-containing protein  30.23 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0757  hypothetical protein  31.4 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  28.57 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2968  calcium-binding EF-hand-containing protein  32.89 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0334384 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3380  signal transduction protein  24.62 
 
 		 209 aa  48.9  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2148  calcium-binding EF-hand-containing protein  25 
 
 		 143 aa  47.4  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0440  calcium-binding EF-hand protein  30.23 
 
 		 226 aa  45.1  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0765893  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0488  calcium-binding EF-hand  32 
 
 		 155 aa  44.7  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0133587  normal  0.146102 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3284  signal transduction protein  29.69 
 
 		 139 aa  43.9  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0725465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3148  hypothetical protein  30.08 
 
 		 143 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4199  signal transduction protein  28.36 
 
 		 282 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0835  EF hand domain protein  31.2 
 
 		 144 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2073  signal transduction protein  29.75 
 
 		 212 aa  41.6  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0851765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1114  hypothetical protein  29.51 
 
 		 153 aa  41.2  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0883796 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>