24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0835 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0835  EF hand domain protein  100 
 
 		 144 aa  289  7e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3148  hypothetical protein  63.38 
 
 		 143 aa  186  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3064  hypothetical protein  62.68 
 
 		 144 aa  168  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6104  calcium-binding protein  39.13 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1867  calcium-binding protein  39.13 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0488  calcium-binding EF-hand  31.37 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0133587  normal  0.146102 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3284  signal transduction protein  36.94 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0725465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1114  hypothetical protein  34.75 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0883796 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2073  signal transduction protein  32.43 
 
 		 212 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0851765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2178  hypothetical protein  32.68 
 
 		 167 aa  47.8  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0312897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0416  calcium-binding EF-hand domain-containing protein  31.53 
 
 		 218 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2384  hypothetical protein  25.36 
 
 		 163 aa  46.2  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190826 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0139  hypothetical protein  41.67 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0820746  normal  0.13795 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3135  calcium-binding EF-hand  27.85 
 
 		 164 aa  43.9  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.850385  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0175  calcium-binding EF-hand-containing protein  26.76 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.288154  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0271  Calcium-binding EF-hand-containing protein  28.15 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0508826 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1482  acid-shock protein  27.52 
 
 		 188 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3230  signal transduction protein  39.19 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.263542 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1986  putative signal peptide protein  31.31 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1843  acid-shock protein  48.72 
 
 		 177 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.147127  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3604  signal transduction protein  26.12 
 
 		 137 aa  40.4  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0412957  hitchhiker  0.00158231 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0946  hypothetical protein  30.25 
 
 		 198 aa  40.4  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.587997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8024  Calcium-binding EF-hand-containing protein  29.37 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0823  hypothetical protein  23.61 
 
 		 138 aa  40  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.112496 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>