19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0175 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0175  calcium-binding EF-hand-containing protein  100 
 
 		 147 aa  303  3e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.288154  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0177  hypothetical protein  42.65 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.10535  normal  0.971448 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2148  calcium-binding EF-hand-containing protein  28.87 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1266  calcium-binding EF-hand-containing protein  26.76 
 
 		 167 aa  52  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.567  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  37.5 
 
 		 194 aa  50.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49728  predicted protein  29.41 
 
 		 522 aa  47.4  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0014684  normal  0.217653 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2469  putative signal transduction protein with EFhand domain  27.43 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_24253  predicted protein  27.89 
 
 		 479 aa  43.5  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.334979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1228  signal transduction protein  33.8 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522863  normal  0.321089 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1114  hypothetical protein  29.06 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0883796 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04858  EF hand domain protein  33.01 
 
 		 193 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.269364  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0833  Calcium-binding EF-hand-containing protein  46.67 
 
 		 135 aa  41.6  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0359291  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2120  putative signal transduction protein with EFhand domain  41.3 
 
 		 139 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1110  hypothetical protein  27.78 
 
 		 187 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.124565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  29.03 
 
 		 190 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3284  signal transduction protein  30.56 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0725465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1482  acid-shock protein  26.77 
 
 		 188 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3380  signal transduction protein  31.46 
 
 		 209 aa  40.4  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2297  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  40.35 
 
 		 397 aa  40.4  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.66755  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>