25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2120 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2120  putative signal transduction protein with EFhand domain  100 
 
 		 139 aa  274  3e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1362  EF hand domain-containing protein  36.07 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0048155  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0821  calcium-binding EF-hand-containing protein  51.85 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.661714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2987  EF hand domain-containing protein  44.93 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0450  hypothetical protein  43.04 
 
 		 266 aa  53.9  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1228  signal transduction protein  43.4 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522863  normal  0.321089 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0064  Calcium-binding EF-hand-containing protein  38.75 
 
 		 213 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.916763  normal  0.014453 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0175  calcium-binding EF-hand-containing protein  34.78 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.288154  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0139  hypothetical protein  36.25 
 
 		 162 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0820746  normal  0.13795 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5705  calcium-binding EF-hand-containing protein  44.78 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0268873  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1629  signal transduction protein  36.49 
 
 		 170 aa  44.3  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2853  hypothetical protein  37.5 
 
 		 173 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.652841  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0757  hypothetical protein  31.45 
 
 		 203 aa  43.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0988  hypothetical protein  38.27 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3298  hypothetical protein  46 
 
 		 218 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  43.33 
 
 		 194 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1142  calcium-binding EF-hand-containing protein  48.94 
 
 		 76 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.234419  normal  0.629098 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0065  signal transduction protein  38.98 
 
 		 122 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_24253  predicted protein  34.85 
 
 		 479 aa  41.2  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.334979  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2397  EF hand domain-containing protein  46.15 
 
 		 218 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  35.29 
 
 		 205 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2469  putative signal transduction protein with EFhand domain  34.78 
 
 		 125 aa  40.4  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3380  signal transduction protein  43.14 
 
 		 209 aa  40.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0081  Calcium-binding EF-hand-containing protein  39.66 
 
 		 212 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04858  EF hand domain protein  35.8 
 
 		 193 aa  40  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.269364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>