20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5705 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5705  calcium-binding EF-hand-containing protein  100 
 
 		 154 aa  297  5e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0268873  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1629  signal transduction protein  61.82 
 
 		 170 aa  130  5e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3976  signal transduction protein  77.14 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.895273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0640  putative signal transduction protein with EFhand domain  70.67 
 
 		 125 aa  114  6e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.416119  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0661  signal transduction protein  58.33 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.152046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1363  signal transduction protein  48.94 
 
 		 202 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1110  hypothetical protein  50 
 
 		 187 aa  47.4  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.124565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3380  signal transduction protein  43.94 
 
 		 209 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0985  signal transduction protein  36.14 
 
 		 196 aa  44.7  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3772  hypothetical protein  42.19 
 
 		 106 aa  44.7  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0190888 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0112  acid shock protein-like  36.49 
 
 		 126 aa  43.9  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.51175 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04858  EF hand domain protein  37.1 
 
 		 193 aa  43.9  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.269364  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0065  signal transduction protein  37.84 
 
 		 122 aa  43.9  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2469  putative signal transduction protein with EFhand domain  43.18 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2120  putative signal transduction protein with EFhand domain  48.98 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  40 
 
 		 194 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2405  hypothetical protein  32.47 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  37.74 
 
 		 205 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  37.74 
 
 		 205 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0097  calcium-binding EF-hand-containing protein  41.89 
 
 		 132 aa  40.4  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>