21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3976 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3976  signal transduction protein  100 
 
 		 149 aa  283  4e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.895273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0640  putative signal transduction protein with EFhand domain  78.48 
 
 		 125 aa  131  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.416119  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1629  signal transduction protein  53.97 
 
 		 170 aa  123  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0661  signal transduction protein  77.94 
 
 		 125 aa  118  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.152046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5705  calcium-binding EF-hand-containing protein  77.61 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0268873  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  46.48 
 
 		 194 aa  60.8  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  40.79 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  40.79 
 
 		 205 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  47.06 
 
 		 190 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0985  signal transduction protein  40.38 
 
 		 196 aa  44.7  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1110  hypothetical protein  50 
 
 		 187 aa  44.3  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.124565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04624  hypothetical protein  36 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1363  signal transduction protein  41.3 
 
 		 202 aa  43.9  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3380  signal transduction protein  43.75 
 
 		 209 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14031  hypothetical protein  35.94 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.10797 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2469  putative signal transduction protein with EFhand domain  36.36 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04241  EF hand domain protein  30.77 
 
 		 113 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0065  signal transduction protein  35 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2277  calcium-binding EF-hand  47.83 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677939  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0152  signal transduction protein  50 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1653  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  44.9 
 
 		 390 aa  40.4  0.009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>