22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0640 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0640  putative signal transduction protein with EFhand domain  100 
 
 		 125 aa  251  3e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.416119  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0661  signal transduction protein  96.46 
 
 		 125 aa  224  4e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.152046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3976  signal transduction protein  77.63 
 
 		 149 aa  126  8.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.895273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5705  calcium-binding EF-hand-containing protein  56.44 
 
 		 154 aa  111  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0268873  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1629  signal transduction protein  54.78 
 
 		 170 aa  108  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  41.77 
 
 		 194 aa  51.2  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1363  signal transduction protein  43.75 
 
 		 202 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  42.86 
 
 		 190 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1110  hypothetical protein  47.5 
 
 		 187 aa  43.9  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.124565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  41.67 
 
 		 205 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3880  hypothetical protein  51.28 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  41.67 
 
 		 205 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5798  Calcium-binding EF-hand-containing protein  34.43 
 
 		 97 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04624  hypothetical protein  36.73 
 
 		 135 aa  41.6  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2469  putative signal transduction protein with EFhand domain  38.64 
 
 		 125 aa  41.2  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2073  signal transduction protein  44.9 
 
 		 212 aa  40.8  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0851765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0416  calcium-binding EF-hand domain-containing protein  44.9 
 
 		 218 aa  40.8  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0985  signal transduction protein  43.18 
 
 		 196 aa  40.8  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0389  hypothetical protein  29.92 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0896126  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1009  calcium-binding EF-hand  39.29 
 
 		 201 aa  40.4  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0267  calcium-binding EF-hand  26.96 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0346  Calcium-binding EF-hand-containing protein  37.21 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>