34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0389 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0389  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  268  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0896126  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5853  hypothetical protein  67.74 
 
 		 96 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.502913  normal  0.827274 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2405  hypothetical protein  60.87 
 
 		 97 aa  117  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2059a  hypothetical protein  76.12 
 
 		 105 aa  108  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3880  hypothetical protein  60.55 
 
 		 109 aa  100  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5773  hypothetical protein  44.09 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46530  hypothetical protein  41.49 
 
 		 101 aa  67.4  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00204411  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  39.74 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  38.46 
 
 		 205 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  50.94 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3579  calcium-binding EF-hand  42.5 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.56179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2724  calcium-binding EF-hand  40.85 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  40.62 
 
 		 190 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0984  hypothetical protein  43.14 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3380  signal transduction protein  40.98 
 
 		 209 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0374  hypothetical protein  52.5 
 
 		 134 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.79662  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0394  hypothetical protein  52.5 
 
 		 134 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0584  hypothetical protein  39.29 
 
 		 132 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.506035  hitchhiker  0.00941116 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0133  hypothetical protein  39.29 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.165134  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0616  hypothetical protein  39.29 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.642122  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0065  signal transduction protein  38.1 
 
 		 122 aa  45.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5196  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3359  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2758  hypothetical protein  33.33 
 
 		 120 aa  45.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.8754 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2769  hypothetical protein  37.5 
 
 		 133 aa  44.7  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0517  hypothetical protein  37.5 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.528865  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0541  hypothetical protein  37.5 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3698  hypothetical protein  35.71 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.386998  normal  0.597407 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1363  signal transduction protein  41.3 
 
 		 202 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3421  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4096  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4746  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1174  hypothetical protein  33.33 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5191  hypothetical protein  32.31 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>