31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5196 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5196  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  288  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3359  hypothetical protein  97.48 
 
 		 132 aa  237  5e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4746  hypothetical protein  88.46 
 
 		 143 aa  218  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3421  hypothetical protein  88.46 
 
 		 143 aa  218  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5191  hypothetical protein  83.2 
 
 		 142 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4096  hypothetical protein  88.89 
 
 		 139 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2758  hypothetical protein  90.57 
 
 		 120 aa  200  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.8754 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0394  hypothetical protein  60.19 
 
 		 134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0374  hypothetical protein  59.62 
 
 		 134 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.79662  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0517  hypothetical protein  34.19 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.528865  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1174  hypothetical protein  38.55 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2769  hypothetical protein  38.46 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0541  hypothetical protein  37.78 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2491  hypothetical protein  31.67 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3453  hypothetical protein  31.67 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574961  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1271  hypothetical protein  31.67 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0411  hypothetical protein  31.67 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22812  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3490  hypothetical protein  31.67 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0616  hypothetical protein  40.79 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.642122  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0133  hypothetical protein  40.79 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.165134  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3491  hypothetical protein  31.67 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3294  hypothetical protein  31.67 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0584  hypothetical protein  38.67 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.506035  hitchhiker  0.00941116 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3698  hypothetical protein  32.22 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.386998  normal  0.597407 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  35.06 
 
 		 194 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0389  hypothetical protein  33.8 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0896126  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2059a  hypothetical protein  36.62 
 
 		 105 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3880  hypothetical protein  48.78 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5853  hypothetical protein  36.92 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.502913  normal  0.827274 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  30.3 
 
 		 205 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  30.3 
 
 		 205 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>