29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_3453 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2491  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  265  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3453  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  265  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574961  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1271  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  265  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0411  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  265  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22812  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3490  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  265  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3294  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  264  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3491  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  264  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1174  hypothetical protein  91.73 
 
 
133 aa  228  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0517  hypothetical protein  70.8 
 
 
132 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.528865  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0541  hypothetical protein  70.8 
 
 
134 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3698  hypothetical protein  72.45 
 
 
132 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.386998  normal  0.597407 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2769  hypothetical protein  75.56 
 
 
133 aa  142  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0616  hypothetical protein  72.22 
 
 
133 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.642122  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0133  hypothetical protein  72.22 
 
 
133 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.165134  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0584  hypothetical protein  70.65 
 
 
132 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.506035  hitchhiker  0.00941116 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5196  hypothetical protein  31.09 
 
 
142 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3421  hypothetical protein  56.1 
 
 
143 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4746  hypothetical protein  56.1 
 
 
143 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4096  hypothetical protein  56.1 
 
 
139 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2758  hypothetical protein  37.8 
 
 
120 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.8754 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3359  hypothetical protein  30.25 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5191  hypothetical protein  49.06 
 
 
142 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0374  hypothetical protein  42.65 
 
 
134 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.79662  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0394  hypothetical protein  42.65 
 
 
134 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  30.88 
 
 
205 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  29.41 
 
 
205 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0884  hypothetical protein  38.55 
 
 
131 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1553  hypothetical protein  38.55 
 
 
102 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.787246  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2165  hypothetical protein  35.29 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>